Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms