Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04224 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04224 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04224 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04224 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04224 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04224 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04224 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04224 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms