Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01822 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01822 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01822 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01822 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01822 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01822 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01822 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms