Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01724 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01724 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01724 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01724 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01724 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01724 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01724 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
P01724 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01724 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01724 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01724 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms