Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01678 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01678 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01678 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01678 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01678 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01678 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01678 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01678 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01678 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01678 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01678 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01678 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01678 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01678 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01678 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01678 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms