Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifnb1P01575 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ifnb1P01575 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifnb1P01575 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms