Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apaf1O88879 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apaf1O88879 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms