Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AvilO88398 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AvilO88398 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AvilO88398 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AvilO88398 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AvilO88398 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AvilO88398 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AvilO88398 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AvilO88398 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AvilO88398 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AvilO88398 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AvilO88398 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AvilO88398 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AvilO88398 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AvilO88398 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AvilO88398 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AvilO88398 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AvilO88398 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AvilO88398 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AvilO88398 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AvilO88398 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms