Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma3O70435 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma3O70435 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms