Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf5O70191 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf5O70191 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms