Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms