Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd70O55237 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd70O55237 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms