Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb5O55234 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms