Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt5hO55201 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt5hO55201 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms