Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp2a2O55143 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms