Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif6O55135 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif6O55135 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif6O55135 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms