Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms