Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms