Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FxnO35943 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FxnO35943 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FxnO35943 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FxnO35943 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FxnO35943 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FxnO35943 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FxnO35943 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FxnO35943 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FxnO35943 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FxnO35943 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FxnO35943 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FxnO35943 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FxnO35943 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FxnO35943 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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FxnO35943 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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FxnO35943 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FxnO35943 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms