Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1baO35930 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gp1baO35930 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gp1baO35930 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gp1baO35930 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms