Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms