Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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