Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NudcO35685 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NudcO35685 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NudcO35685 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NudcO35685 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NudcO35685 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NudcO35685 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NudcO35685 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NudcO35685 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NudcO35685 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NudcO35685 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NudcO35685 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NudcO35685 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NudcO35685 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NudcO35685 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NudcO35685 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms