Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx8O35652 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx8O35652 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms