Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms