Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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