Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkd2O35245 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms