Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn4O35054 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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