Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms