Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfil3O08750 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nfil3O08750 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nfil3O08750 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nfil3O08750 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nfil3O08750 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms