Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MttpO08601 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MttpO08601 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MttpO08601 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MttpO08601 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MttpO08601 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MttpO08601 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MttpO08601 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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