Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna4O08542 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms