Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1oL7MU04 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms