Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms