Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Gm379J3QQ19 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm379J3QQ19 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Gm379J3QQ19 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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