Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms