Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm2035J3QP87 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm2035J3QP87 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm2035J3QP87 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm2035J3QP87 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm2035J3QP87 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm2035J3QP87 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm2035J3QP87 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms