Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms