Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm20918J3QN17 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm20918J3QN17 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm20918J3QN17 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm20918J3QN17 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm20918J3QN17 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm20918J3QN17 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20918J3QN17 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20918J3QN17 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20918J3QN17 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20918J3QN17 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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