Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zfp616J3QN14 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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