Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700014D04RikJ3QMS2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms