Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3336J3QMQ6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm3336J3QMQ6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm3336J3QMQ6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm3336J3QMQ6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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