Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms