Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm21411J3KMS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm21411J3KMS0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21411J3KMS0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21411J3KMS0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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