Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20696H3BJN7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms