Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfip1G5E8V9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms