Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp17lcG5E8I7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lcG5E8I7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms