Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4933406M09RikG3XA12 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms