Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms