Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610008E11RikG3X964 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms